Interaction entre les communautés endophytes du xylème et les bactéries phytopathogènes : le cas de Brenneria salicis et Xylella fastidiosa chez les saules et peupliers

Details

Supervisors

Bragard, Claude

Faculty

Faculté des bioingénieurs

Degree label

Master [120] : bioingénieur en sciences agronomiques, à finalité spécialisée

Abstract

Le xylème des plantes, tissu essentiel au transport de l'eau et des nutriments, constitue un environnement unique abritant une diversité de microorganismes. Ces communautés microbiennes jouent un rôle clé dans la santé des plantes, mais leur équilibre peut être perturbé par des pathogènes spécialistes du xylème tels que Xylella fastidiosa et Brenneria salicis. Ces pathogènes, responsables de maladies graves, posent un défi majeur pour la protection des écosystèmes agricoles et naturels. Ils partagent des hôtes potentielles communes au sein de la famille de Salicaceae appartenant aux genre Salix et Populus. Ces arbres, largement répandus dans les régions tempérées, sont des modèles d’étude pertinents pour explorer les interactions complexes entre les communautés endophytes du xylème et les bactéries phytopathogènes. Ce travail vise, d’une part, à caractériser la diversité microbienne du xylème par des, approches culture-dépendantes et métagénomiques, et, d’autre part, à évaluer l’efficacité de certains endophytes à limiter la colonisation des pathogènes in vivo. bien que certaines limitations techniques nécessitent des ajustements protocolaires, les résultats obtenus suggèrent que les endophytes sélectionnés ont des propriétés antagonistes contre Xylella fastidiosa, au sein de Nicotiana tabacum var. Xanthi en conditions contrôlées. La diversité taxonomique des microbiotes xylémiens de Salix et Populus a révélé des variations significatives selon les espèces hôtes. Ces différences, confrontées à la littérature, mettent en lumière des spécificités propres à la famille des Salicaceae et des divergences notables avec d'autres microbiotes xylémiens, comme celui de l’olivier. En conclusion, ce mémoire permet d'envisager des pistes d'améliorations des expériences réalisées et souligne le potentiel des endophytes comme agents de biocontrôle durable et met en avant l'importance d'approches intégratives pour répondre aux défis posés par les pathogènes du xylème. Ces résultats ouvrent des perspectives prometteuses pour protéger les cultures essentielles tout en favorisant une gestion écologique et durable des écosystèmes.