Étude de la sensibilité des Salicacées à Xylella fastidiosa en Belgique : caractérisation des communautés bactériennes endophytes de Populus tremula

Details

Supervisors

Bragard, Claude

Faculty

Faculté des bioingénieurs

Degree label

Master [120] : bioingénieur en sciences agronomiques, à finalité spécialisée

Abstract

Xylella fastidiosa est une bactérie phytopathogène transmise par des insectes piqueurs du xylème. Elle est responsable d’importants dégâts sur des plantes d’intérêt agronomique et écologique telles que la vigne, les agrumes, les amandiers, les caféiers et les pêchers, mais aussi sur plusieurs espèces forestières. Les symptômes typiques de la bactérie sont des chloroses et nécroses marginales foliaires, parfois associées à un dépérissement total de l’individu atteint. Cette bactérie est établie dans de nombreuse régions à travers le monde, notamment en Europe où elle fit son apparition sur oliviers en Italie sans doute avant 2013. Considérée comme un agent de quarantaine au niveau européen, X. fastidiosa a aussi été découverte et s’est établie en France, en Espagne et au Portugal. Dans l’optique de contribuer à l'évaluation du risque d'introduction, d'établissement et de propagation de X. fastidiosa en Belgique, ce mémoire vise à étudier des plantes hôtes potentielles de X. fastidiosa en Belgique ainsi que l’influence de la température sur le développement de la bactérie. Les Salicacées sont une famille de plantes caractéristiques des zones humides, niche favorable à la fois pour X. fastidiosa et certains insectes vecteurs potentiels. En Belgique, les Salicacées forment un important maillage écologique le long des cours d'eau, des forêts et des routes. C’est pourquoi, ce mémoire s’est focalisé sur quatre espèces végétales de la famille des Salicacées : Populus tremula, Populus canescens, Salix alba et Salix caprea. Les plantes ont été inoculées avec la souche modifiée KLN 59.3 de X. fastidiosa subsp. fastidiosa (Newman et al., 2003), qui exprime la protéine fluorescente verte, et l’étude de leur sensibilité à la bactérie s’est faite via plusieurs méthodes de détections : la PCR, la PCR quantitative en temps réel et la microscopie confocale. En parallèle, une étude des communautés bactériennes endophytes au sein des P. tremula a aussi été menée. La recherche, menée en condition de biosécurité, a permis de montrer le potentiel de P. tremula comme hôte potentiel de X. fastidiosa, avec une multiplication et une mobilité de X. fastidiosa dans la plante, vérifié en microscopie et par PCR, ainsi que via un réisolement de la bactérie. Le potentiel hôte des autres plantes testées est aussi discuté. La détection de la bactérie dans les racines est également un élément à relever. Finalement, nous avons pu isoler plusieurs bactéries identifiées comme endophytes potentiels de P. tremula. Ce travail ouvre des perspectives pour mieux comprendre l’adaptation de X. fastidiosa à ses plantes hôtes et sa capacité à s’établir dans des régions tempérées européennes, avec des températures moins élevées que dans les régions du sud de l’Europe. Ces résultats permettront de réagir plus efficacement pour limiter les risques de propagation de la bactérie si celle-ci venait à être détectée en Belgique.

Citations

• APA

Géradin, A. (2022). Étude de la sensibilité des Salicacées à Xylella fastidiosa en Belgique : caractérisation des communautés bactériennes endophytes de Populus tremula.