Immunogénicité de néo-peptides tumoraux induits par des instabilités microsatellitaires

Details

Supervisors

Van Der Bruggen, Pierre

Degree label

Master [120] en sciences biomédicales, à finalité approfondie

Abstract

Les patients atteints du syndrome de Lynch développent des cancers plus fréquemment que la population générale. Ce syndrome est caractérisé par une défaillance du système de réparation de mésappariement ("mismatch repair deficiency" dMMR). Ces erreurs de mésappariement apparaissent plus couramment dans des régions répétitives, telles que les microsatellites, les rendant instables ("microsatellite instability" MSI). L’absence de réparation de ces erreurs génère des insertions ou des délétions d'un à deux nucléotides, causant un décalage du cadre de lecture. Ces décalages dans certains gènes peuvent engendrer de nouveaux peptides antigéniques. Les gènes les plus souvent atteints pouvant être prédits grâce à la présence de microsatellites, un vaccin codant pour les peptides néoantigéniques issus de ces gènes a été développé. Ces peptides seraient utiles pour activer des lymphocytes T cytotoxiques (CTLs) et cibler spécifiquement les cellules tumorales. En guise de "preuve de concept" de cette approche thérapeutique, nous désirons tester la reconnaissance, à la surface de tumeurs, de 10 des peptides encodés par le vaccin par des CTLs préalablement isolés. Durant ce travail, des CTLs humains spécifiques pour ces peptides ont été isolés en utilisant des complexes peptide-HLA multimériques. Ces CTLs spécifiques ont alors été amplifiés avec des cellules stimulatrices présentant les peptides d'intérêt. La reconnaissance des peptides testés encodés par le vaccin par les CTLs amplifiés est testée pour voir si ces peptides sont reconnus à la surface de cellules lorsqu'ils sont apprêtés par les cellules. Certains peptides sont reconnus lorsqu'ils sont chargés à la surface de cellules mais pas lorsqu'ils sont apprêtés. Nous avons voulu savoir si la voie d'apprêtement, et plus précisément les différents types de protéasomes, avait un impact sur la reconnaissance des peptides. La reconnaissance des peptides encodés par le vaccin est donc testée lorsque ceux-ci sont apprêtés par des cellules exprimant soit le protéasome standard, soit l'immunoprotéasome. Est aussi testée la reconnaissance des peptides digérés in vitro par le protéasome standard ou par l'immunoprotéasome, puis pulsés à la surface de cellules. En parallèle la reconnaissance des peptides présents à la surface d'une lignée cellulaire de cancer du côlon humain est testée pour voir si effectivement le vaccin est capable d'induire une réponse dirigée contre ces cellules tumorales.