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Développement d’une alternative thérapeutique basée sur les bactériocines pour traiter le réservoir récalcitrant de Staphylococcus aureus intracellulaire dans des macrophages

(2024)

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Abstract
Staphylococcus aureus est une bactérie Gram positive qui se trouve de manière commensale chez environ un tiers de la population, mais qui est également capable de causer une grande variété d'infections chez l'homme. S. aureus est généralement considéré comme un pathogène extracellulaire ; cependant, plusieurs études ont montré qu’une proportion de bactéries peut également survivre et se reproduire à l'intérieur des cellules. À l'intérieur des cellules hôtes, S. aureus est protégé contre la réponse immunitaire, l'action létale des antibiotiques, et forme un réservoir intracellulaire récalcitrant associé aux infections chroniques et systémiques. Il est donc nécessaire d'en connaitre davantage sur ce mode de vie intracellulaire, de comprendre comment les staphylocoques survivent dans les macrophages et comment cette proportion de bactéries est capable de survivre de manière récalcitrante aux traitements antibiotiques ou autres stress générés par les macrophages. L’objectif principal de ce mémoire porte sur la caractérisation de ce réservoir intracellulaire, son impact sur l’activité des antibiotiques et le développement d’une potentielle alternative thérapeutique. Afin de mieux comprendre l’effet de cet environnement, un milieu de culture mimiquant les conditions intracellulaires des lysosomes des macrophages (ALM) fut développé. Nos résultats initiaux suggèrent que l'environnement à l'intérieur des macrophages module fortement l'efficacité des antibiotiques en raison de l'activité métabolique réduite de S. aureus, mais aussi en raison de l’incapacité des antibiotiques à induire correctement leur action. Les données obtenues dans ce milieu peuvent expliquer une grande partie de l’inefficacité des antibiotiques pour traiter les infections intracellulaires. L’activité potentielle des bactériocines a été examinée en parallèle et nous avons pu identifier plusieurs candidats positifs actifs contre S. aureus. Une librairie de rapporteurs transcriptionnels fluorescents a été mise au point et permettra de suivre la physiologie bactérienne face aux traitements. Dans l’ensemble, notre travail combine des outils moléculaires, des rapporteurs transcriptionnels fluorescents, pour élucider la physiologie de S. aureus pendant le traitement à l’intérieur des cellules hôtes avec le développement de nouvelles stratégies antibactériennes basées sur l’administration intracellulaire de bactériocines synthétiques.